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Outils de génétique - BLAST mycologique combiné Mycoquébec

Insérez une séquence ou récupérez-la à l'aide d'un numéro GenBank, iNat ou de collection MQCOLL. Nous effectuerons ensuite une recherche BLAST dans les bases de données locales sélectionnées et, si désiré, sur GenBank en ligne.

Numéro GenBank :
Numéro iNat :
MQCOLL :
Nom de recherche (optionnel) :
?

Bases de données hébergées localement (plus rapides et mises à jour environ quatre fois par année) :

Mycoquébec (~10 sec.) m.à.j. : quotidienne
MycoMap (~20 sec.) m.à.j. : 2026/02
BOLD (local) (~20 sec.) m.à.j. : 2026/04/04
UNITE (séquences de référence) (~10 sec.) m.à.j. : 2025/02 (dern. dispo)
UNITE (toutes les séquences) (~20 sec.) m.à.j. : 2025/02 (dern. dispo)
GenBank TYPES (~20 sec.) m.à.j. : 2026/04/04

Bases de données hébergées à l'externe (plus lentes et dépendantes de la disponibilité du service) :

GenBank (en ligne) (~50 sec.)
* Formats acceptés : FASTA ou texte brut (GATC seulement)
** Seules les séquences ITS sont indexées sur Mycoquébec.
*** Une identification est généralement jugée significative à plus de 99,5 % d'appariement, mais elle doit toujours être validée manuellement par un expert. Certaines espèces à évolution rapide nécessitent un seuil plus élevé, parfois jusqu'à 100 % d'identité, car de faibles différences nucléotidiques suffisent à distinguer deux espèces. À l'inverse, chez des espèces à évolution plus lente, des espèces morphologiquement différentes peuvent parfois présenter des séquences ITS identiques.
*** Chaque base de données est fournie par un organisme indépendant. Veuillez citer la source appropriée dans toute publication scientifique lorsque son contenu est utilisé de façon pertinente. ?

Résultats :

MQ
MM
BOLD
UN (Refs)
UN (Toutes)
GB-TYPES

Aucun blast effectué sur Mycoquébec jusqu'à maintenant.